Standart cerrahide tiroid bezine ya lobektomi+istmektomi (tiroid bezinin hasta olan tarafının çıkartılması) ya da total tiroidektomi (tamamen çıkartılması) uygulanır. Bazen boyundaki belirlenmiş lenf düğümleri de çıkartılır.

Ameliyat  sinir monitor cihazı ile gerekli bağlantılar yapıldıktan sonra  genel anestezi altında hastaya boynu hafifçe geriye yatırılarak pozisyon verildikten sonra başlar. Boyunca cilt katlantılarına paralel bir kesi ile katmanlar sırası ile geçilir ve tiroid bezine ulaşılır. Önce bir lobda hem dış laringeal sinirin üst dalı hem de rekürren laringeal sinir korunarak tiroid bezi ayrıştırılır. Bu esnada paratiroid bezlerinin kan desteği dikkatli bir şekilde korunur. Ardından diğer taraf çıkartılacaksa o lobda da aynı işlem tekrarlanır. Tiroid bezi tamamen çıkartıldıktan sonra kanama kontrolü yapılıp gerekirse tiroid bezinin çıkartıldığı boşluğa dren konur ve cilt subkutiküler dikişlerle kapatılır. Son yıllarda bazı merkezlerde endoskopik tiroidektomi ve robotik tiroidektomi uygulamaya girmiştir.