Mide kanseri ameliyatı komplike (karmaşık) bir cerrahi işlemdir ve komplikasyonları olabilir.

Bunlar arasında en önemlileri kanama, pıhtı atma ve ameliyat sırasında yakındaki organların hasar görmesidir. Nadiren mide, yemek borusu ve ince bağırsağın uçları arasında yapılan yeni bağlantılarda sızıntı olabilir.

Geç dönemde sindirim sisteminin yapısı değiştiği için yemek sırasında veya yemekten sonra ani başlayan halsizlik, baş dönmesi, baygınlık, çarpıntı ve soğuk terleme ile karakterize dumping sendromu görülebilir. Safralı ince bağırsak içeriği midenin kalan kısmına ya da yemek borusuna geri kaçıp burada tahrişe neden olabilir (alkalen reflü gastrit). Ayrıca ameliyat yerine yakın ince bağırsağın gıda getiren ye da gıdayı götüren kısımlarında tıkanıklık gelişebilir (afferent ans-efferent ans sendromları). Karın içi fıtık oluşabilir. Ameliyat yerinde ülser olması da beklenebilecek diğer komplikasyonlardandır.

Hastalarda ilerleyen dönemde mide olmadığı ve onikiparmak bağırsağı devre dışı kaldığı için kansızlık, vitamin eksikliği gelişebileceğinden bunlara yönelik tedavi başlanır. Kilo kaybı gelişebilir.